Минфин России в письме от 08.06.12 №  03-04-06/6-158 напомнил, что по ставке 13 процентов облагаются не любые доходы высококвалифицированного иностранного специалиста, а только доходы от  трудовой деятельности.

Соответственно, доплаты к отпуску и суммы возмещения различных расходов высококвалифицированного специалиста, не признаваемого налоговым резидентом Российской Федерации, подлежат обложению НДФЛ по ставке 30 процентов.