Упрощенную систему налогообложения не вправе применять организации, у которых остаточная стоимость основных средств и нематериальных активов, определяемая в соответствии с данными бухучета, превышает 100 млн. руб. Такое ограничение установлено подпунктом 16 пункта 3 статьи 346.12 НК РФ.
Амортизируемое имущество, приобретенное некоммерческой организацией за счет целевых поступлений, для целей налогообложения прибыли организаций амортизации не подлежит. При этом не важно, для осуществления какой деятельности (некоммерческой или коммерческой) используется это имущество. Таким образом, некоммерческое партнерство, у которого стоимость основных средств, приобретенных за счет целевых поступлений, превышает 100 млн. руб., вправе применять упрощенную систему налогообложения. Такие разъяснения дает Минфин России в письме от 11.08.2011 № 03-11-06/2/117.