Минфин РФ разъяснил, что налоговые органы не вправе самостоятельно перезачитывать суммы излишне уплаченных налогов или излишне взысканных налогов, пеней и штрафов в счет уплаты налога, по которому недоимка не возникла. В данном случае налогоплательщик должен подать соответствующее заявление.

При этом обязанность по уплате налога считается исполненной со дня вынесения налоговым органом решения о зачете сумм излишне уплаченных или сумм излишне взысканных налогов, пеней и штрафов в счет исполнения обязанности по уплате соответствующего налога. Налоговый орган принимает решение о зачете в течение 10 дней со дня получения заявления от налогоплательщика.

Таким образом, инспекция вправе начислить пени до момента принятия решения о зачете налога, если налогоплательщик подал соответствующее заявление до истечения срока уплаты налога, но позднее чем за 10 дней до этого момента.

Письмо Минфина РФ от 25.07.2011 г. № 03-02-07/1-260