В ситуации, когда предоплата и отгрузка произошли в одном и том же периоде, компания может принять к вычету НДС с предоплаты в этом периоде.

Как разъяснил «Главбуху» Юрий Лермонтов , консультант Минфина России, по общему правилу, налоговая база должна рассчитываться по итогам налогового периода. Полученный компанией аванс нужно включать в базу по НДС. При этом, когда оплаченный товар будет отгружен, НДС надо начислить вновь. Однако одновременно с этим компания вправе принять к вычету НДС, начисленный с аванса.

Более того, арбитражная практика говорит о том, что при оплате и отгрузке в одном налоговом периоде начислять НДС с аванса не нужно вообще. Судьи разъясняют, что в такой ситуации поступивший платеж просто не признается авансовым.

Но в любом случае получается, что по итогам налогового периода вы должны будете перечислить только НДС с отгруженных товаров. Платить еще и налог с аванса никаких оснований нет.