Урегулированы отдельные вопросы, касающиеся деятельности государственных и муниципальных учреждений.

Уточнены положения ряда законодательных актов, в том числе Федерального закона "Об автономных учреждениях".

Так, например, государственным и муниципальным учреждениям, осуществляющим предусмотренные уставом виды деятельности на основании разрешительных документов, после изменения типа учреждения предоставлено право без переоформления документов продолжить осуществлять такую деятельность до окончания срока действия разрешительных документов.

Налоговый кодекс РФ дополнен новыми положениями:

- исключены из объекта налогообложения НДС работы и услуги казенных, бюджетных и автономных учреждений, выполняемые (оказываемые) в рамках государственного (муниципального) задания за счет бюджетных субсидий;

- от налогообложения налогом на прибыль освобождены доходы бюджетных учреждений, доведенные до них в установленном порядке до 1 июля 2012 года, в виде лимитов бюджетных обязательств (бюджетных ассигнований);

- установлены особенности ведения налогового учета бюджетными учреждениями.

Поправками, внесенными в Федеральный закон "Об автономных учреждениях" предусмотрены, в частности, особенности санкционирования операций со средствами, поступающими на лицевые счета автономных учреждений, урегулирован порядок использования в текущем финансовом году остатков бюджетных средств, предоставленных автономным учреждениям.

Согласно ранее действовавшему правилу автономные учреждения, чья деятельность выходила за рамки определенных законодательством сфер деятельности, подлежали реорганизации или ликвидации до 1 января 2012 года. Теперь установлено, что автономные учреждения, в отношении которых до 1 января 2012 года не принято решение о реорганизации, ликвидации или изменении типа, с указанной даты будут являться бюджетными учреждениями. Исключение сделано для созданных до 1 января 2011 года в форме автономных учреждений фондов содействия кредитования, бизнес-инкубаторов и микрофинансовых организаций.