См. Положение о комиссии на сайте ФК.
С одной стороны комиссия создана, в частности, для досудебного урегулирования споров по результатам проверки аудиторских организаций, с другой заседания Комиссии назначаются по мотивированному представлению зам.руководителя ФК. Как мне кажется, прямой обязанности рассмотреть акт проверки на заседании Комиссии нет.
В то же время ФК само активно продвигало идею такой досудебной инстанции. Поэтому, если в возражениях написать, что просите рассмотреть акт проверки и возражения аудиторской организации на заседании Комиссии, сославшись в том числе на цели создания этой Комиссии по Положению, то вряд ли откажут.