НДС

Во время выездной проверки за 2005, 2006г.с 04.03.2008 по 29.04.2008г. бухгалтер подала уточненные декларации по НДС за май, декабрь 2006г. 21.03.2008г.Налоговая в первом акте написала что в силу подпункта 1 пункта 4 статьи 81 и так как числилась переплата налоговая ответственность не принимается, а после подачи разногласий уже посчитали штраф и пени и уже в решение написали согласно статьи 122 пункт 1 применить налоговую отвественность.Так как директор подписал акт не глядя, что теперь прикладывать к аппеляц.жалобе предыдущий акт? Или если во время проверки подаешь уточненную декларацию все таки штрафуют?