Телефон, оплатили наличными

Сотрудник оплатил услуги связи (корпоративный телефон) наличными - а чек не предоставил - и не будет. Как поступить? можно ли все услуги считать затратами? к документам прилагается распечатка баланса, и в сч-фактуре стоит № чека, поминмо №№ платежек

Нет проблем.
Расходы Вы принимаете по документам на расходы (акты, счета от оператора связи).
А то, что у Вас там деньги появились в расчетах неизвестно откуда - это Ваш внереализационный доход.

Есть некоторая проблема с НДС. Но возможно при проверке на этот чек в сф и внимания не обратят.
Ну а если обратят - вряд ли там большая сумма, пусть порадуются, налоркам для проверок тоже надо что-то оставлять.

последствия безвозмездности какие? НДС в части оплаченного безвозмздно - не предъявляем и еще начисляем на сумму полученного безводмездно?

Блин там что - тыща баксов?
Я ж говорю - остаьте все как есть.
Максимум что налорги нароют - снимут часть НДС.
Если вообще заметят.