Как отразить услуги по доставке товара СДЭК в бухгалтерском учете?

Добрый день!

Отправляли товар компанией СДЭК.  Услуги по доставке за счет покупателя. 
За товар мы(ООО) выставили счет покупателю(П) без учета доставки. Покупатель оплатил нам за товар. 
Далее этот товар мы отправляем через транспортную компанию (С) покупателю. 

СДЭК нам выставляет документы со следующими суммами:

Стоимость основной услуги 905 р.
Дополнительная услуга (упаковка) 30 р.
Сумма наложенного платежа 1200 р. 
Размер посреднического вознаграждения 36 р.
Итого услуги по доставке 971 р.  в том числе НДС 5% 46.24

Подскажите пожалуйста, как отразить нам данные суммы в  бухгалтерском учете?

Для точного отражения операций в бухгалтерском учёте рекомендуется обратиться к специалисту.
Возможно, имелись в виду расходы на логистику, связанные с доставкой товара. Такие затраты учитываются на счёте 44 «Расходы на продажу» и относятся на расходы текущего месяца. ⁽¹⁾

Если договором поставки предусмотрена оплата доставки сверх цены товара, то расходы на доставку считаются прямыми расходами. В текущем отчётном (налоговом) периоде организация-покупатель может учесть только ту часть транспортных расходов, которая непосредственно относится к реализованным в этом периоде товарам.
Порядок учёта транспортных расходов при доставке товара до склада торговой организации установлен статьёй 320 НК РФ. Учитывать затраты организация будет в зависимости от того, включена ли стоимость доставки в цену товара или нет. ⁽⁵⁾

Старая песня. У вас есть 2 варианта: либо провести через 76 либо включать в выручку и себестоимость. Разница между ними понятна теоретически, но практически довольно субъективна.

Раньше налоговая была сильно против первого варианта, поэтому в основном компании использовали второй.

Не очень понимаю. 
Услуги сдэк 971 р. Они делают взаимозачет на сумму 971 р. А что делать с наложенным платежом? Наложенные платеж в размере 1200 р. Как я понимаю покупатель заплатил 1200? Если покупатель заплатил 1200, то разницу в сумме 229 р. как отразить?

Чтобы знать, как отразить, нужно понимать, что это такое. Объясните, почему покупатель заплатил 1200 и почему возникла эта разница, тогда будет понятно, как отражать.

Вам сначала надо разобраться с ситуацией, а вы хотите, не разбираясь, что-то где-то отразить.