Счета-фактуры на аванс: хотят передать по ЭДО с опозданием

Добрый день! Часто случается следующая ситуация. В конце квартала поставщик присылает сканы авансовых счетов-фактур на электронную почту. Мы их принимаем к учету. Позже оригиналы приходят с закрывающими (отгрузочными ) документами. Не все поставщики в момент отгрузки вспоминают доложить в конверт авансовые счета-фактуры и начинают предлагать отправить их по ЭДО, 3 месяца спустя. Правильно ли я понимаю, что у меня, если запросят такие документы и увидят даты получения по ЭДО существенно поздними, могут возникнуть проблемы с вычетами НДС за предыдущий квартал?

Вопрос слишком сложен - на нём сломался даже Гуру Бухгалтерии.

Татьяна3333, вы все верно понимаете, проблемы будут. И вот почему.
Чтобы заявить к вычету НДС с аванса, налогоплательщик должен(п.9ст.172 НК РФ):
- получить от поставщика правильно оформленный авансовый счет-фактуру;
- иметь документы подтверждающие факт предоплаты;
- иметь договор, предусматривающий предоплату.
п.8 ст. 172 НК РФ установлено, что вычеты производятся на основании счетов-фактур, выставленных продавцами при получении ими предоплаты и документов, подтв. факт перечисления предоплаты.
Т.о. вычет должен быть заявлен в периоде перечисления предоплаты и путем регистрации в книге покупок авансового счета-фактуры, полученного от продавца.
Как быть в ситуациях, когда авансовый счет-фактура поступает от продавцов уже после  сдачи декларации за тот период, в котором  был фактически уплачен поставщику аванс?
Минфин считает , что в случае если авансовый с-ф выставлен продавцом в одном налоговом периоде, а получен покупателем  в следующем налоговом периоде, вычет суммы налога следует производить в том налоговом периоде в котором с-ф фактически получен.(письма Минфина от 30.12.2020 №03-07-11/116098, от 16.04.2019 № 03-07-09/27004.
При этом возникает вопрос как документально подтвердить дату получения авансового с-ф. При применении ЭДО это просто. А если авансовый с=ф выставлен на бумаге?
Это может быть проблемой. так как на авансовые вычеты не распространяется п.1.1 ст.172 НК РФ, позволяющий пользоваться вычет ом в любом квартале в течение 3-х лет. Поэтому при исп. покупателем авансового вычета не в том квартале ,когда был уплачен аванс и выставлен авансовый с-ф продавцом, возникает риск отказа в вычете по причине того, что он заявлен не в том налоговом периоде ,когда был уплачен аванс, а самостоятельно перенесен на следующие налоговые периоды.

Ольга, спасибо за такой развернутый ответ. ЭДО , конечно, удобная вещь, но когда все приходит своевременно. Главное, чтобы бумажный счет-фактура был на месте, когда он может кому-то потребоваться.

Татьяна3333, уже давно пора отказаться о бумажного НДС. Всех даже ИП переводим на ЭДО. 

Бульдозер
Вопрос слишком сложен - на нём сломался даже Гуру Бухгалтерии.

Гуру Бухгалтерии не отвечает на вопросы незарегистрированных пользователей.

Ольга, наверное речь все же о бумажном счете-фактуре? 
По поводу документов по ЭДО, это хорошо и удобно, но сталкивалась с тем, что закрывающие документы присылали спустя приличное время с даты выписки, через месяцы, в следующем квартале, тихо, в надежде, что подпишут, не глядя.

Нет с-ф , нет вычета. Другого здесь не скажешь. Если с-ф авансовый, то переносить на иной квартал нельзя.