перевыставление расходов Арендодателю

Здравствуйте. Арендатор по требованию Арендодателя может произвести капитальный ремонт арендной техники, с перевыставлением счетов Арендодателю, поскольку последний не имеет ресурсной возможности на его проведение. Договором предусмотрена обязанность Арендодателя в проведении капремонта.
Может ли налоговый орган переквалифицировать договор аренды в договор на оказание услуг? Все акты будут подписаны  сотрудниками Арендатора.

Если будете выражаться терминами типа "может", то ИФНС всегда найдет, к чему придраться. Придется судиться.
Чья обязанность выполнять кап. ремонт?
В пункте 1 статьи 616 ГК РФ указано:

1. Арендодатель обязан производить за свой счет капитальный ремонт переданного в аренду имущества, если иное не предусмотрено законом, иными правовыми актами или договором аренды.
Капитальный ремонт должен производиться в срок, установленный договором, а если он не определен договором или вызван неотложной необходимостью, в разумный срок.
Нарушение арендодателем обязанности по производству капитального ремонта дает арендатору право по своему выбору:
произвести капитальный ремонт, предусмотренный договором или вызванный неотложной необходимостью, и взыскать с арендодателя стоимость ремонта или зачесть ее в счет арендной платы;
потребовать соответственного уменьшения арендной платы;
потребовать расторжения договора и возмещения убытков.


В Вашей ситуации, чья обязанность, т.е. за чей счет, следует выполнять кап. ремонт?
Если договорились, что за счет Арендатора, приведите в соответствие договор и доп. соглашения в соответствии со ст. 616 ГК РФ.