В письме от 1 июня 2016 г. N 17-3/В-232 Минтруд указал: если организация производит выплаты физлицам, которые состоят с ней в трудовых отношениях или заключили гражданско-правовые договоры на выполнение работ, оказание услуг, то суммы выплат (за исключением поименованных в статье 9 закона 212-ФЗ) облагаются взносами независимо от источника их финансирования, в том числе за счет средств перечисленного на счет организации гранта.

Если выплаты за счет средств гранта производятся грантодателем в пользу грантополучателя - физлица, которое не состоит в трудовых отношениях и не заключило гражданско-правовых договоров с грантодателем, то объектом обложения взносами такие суммы не признаются.