В письме от 24.05.16 № СД-3-3/2348 ФНС напомнила, что применение УСН предусматривает освобождение ИП от НДФЛ в отношении доходов, полученных от предпринимательской деятельности, за исключением НДФЛ, уплачиваемого с доходов в виде дивидендов, а также с доходов, облагаемых по налоговым ставкам, предусмотренным подпунктами 2 и 5 статьи 224 НК.

Налогоплательщики, применяющие УСН, учитывают доходы от реализации и внереализационные доходы, определяемые в соответствии со статьями 249 и 250 НК.

Пунктом 1 статьи 249 НК установлено, что доходом от реализации признаются выручка от реализации товаров (работ, услуг) как собственного производства, так и ранее приобретенных, выручка от реализации имущественных прав. При этом в целях налогообложения товары определяются в соответствии с пунктом 3 статьи 38 НК, согласно которому товаром признается любое имущество, реализуемое либо предназначенное для реализации.

Таким образом, доходы ИП, полученные от реализации недвижимости, признаются доходом от реализации и подлежат налогообложению при применении УСН.

Если принадлежащее на праве собственности имущество сдавалось в аренду в рамках заявленных ИП при госрегистрации видов деятельности, имеются факты получения доходов от сдачи помещения в аренду, ведения учета соответствующих хозопераций, то доходы от продажи нежилого помещения рассматриваются как доходы от предпринимательской деятельности. При этом также принимается во внимание, что нежилое помещение по общему правилу, по мнению ФНС, изначально не предназначено для использования в иных целях, не связанных с предпринимательской деятельностью.

ФНС подтвердила это арбитражной практикой, приведя в качестве примеров определения ВС от 30.12.2015 N 306-КГ15-17368 по делу N А12-33256/2014, от 05.10.2015 N 304-КГ15-12005 по делу N А27-18615/2014, определение ВАС от 21.03.2014 N ВАС-2475/14 по делу N А73-15778/2012.