В письме от 10.02.2016 № 03-02-07/2/7100 Минфин напомнил, что согласно пункту 1 статьи 78 НК сумма излишне уплаченного налога подлежит зачету в счет погашения недоимки по иным налогам соответствующего вида и задолженности по пеням, штрафам. Такой зачет на основании абзацев первого и второго пункта 5 статьи 78 НК должен производиться налоговыми органами самостоятельно. При этом решение о проведении указанного зачета должно приниматься налоговым органом в короткий срок (а именно в течение 10 рабочих дней) со дня обнаружения им факта излишней уплаты налога или со дня подписания налоговым органом и налогоплательщиком акта совместной сверки уплаченных им налогов, если такая совместная сверка проводилась, либо со дня вступления в силу решения суда.

Вместе с тем, абзацем третьим пункта 5 статьи 78 НК указывается на возможность представления в налоговый орган налогоплательщиком заявления о зачете суммы излишне уплаченного налога в счет погашения недоимки (задолженности по пеням, штрафам). В этом случае решение налогового органа о зачете должно приниматься в течение 10 рабочих дней со дня получения заявления или со дня подписания акта сверки (если она проводилась).

НК не определены особенности проведения налоговым органом зачета самостоятельно при наличии хотя бы одного из обстоятельств, указанных в пункте 5 статьи 78 НК, по истечении срока, установленного названным пунктом, в случае, когда отсутствуют недоимка и задолженность по пеням и штрафам, по которым должен быть проведен зачет налоговым органом самостоятельно, а также отсутствует заявление налогоплательщика о зачете суммы излишне уплаченного налога в счет предстоящих его платежей по этому или иным налогам соответствующего вида либо о возврате такой суммы налога.

Пунктом 7 статьи 78 НК установлен трехлетний период для подачи налогоплательщиком заявления о зачете или о возврате.

Минфин поддерживает предложение о внесении изменения в пункт 5 указанной статьи об установлении трехлетнего периода со дня излишней уплаты суммы налога, в пределах которого налоговым органом может проводиться зачет такой суммы самостоятельно.

Напомним, что ранее ведомство выпускало разъяснения, согласно которым налоговики могут самостоятельно проводить зачет суммы излишне уплаченного налога, в том числе если со дня его уплаты истекло более трех лет, в счет погашения недоимки по иным налогам, задолженности по пеням и (или) штрафам. ФНС, разослав эти разъяснения, позже отменила их.