В письме от 25.01.16 № 03-07-11/2722 Минфин напомнил, что счета-фактуры должны выставляться не позднее пяти календарных дней, считая со дня отгрузки товаров (выполнения работ, оказания услуг). В счете-фактуре должны быть указаны порядковый номер и дата выписки.

В соответствии с абзацем вторым пункта 2 статьи 169 НК ошибки в счетах-фактурах, не препятствующие налоговым органам при проведении налоговой проверки идентифицировать продавца, покупателя товаров (работ, услуг), имущественных прав, наименование товаров (работ, услуг), имущественных прав, их стоимость, а также налоговую ставку и сумму налога, предъявленную покупателю, не являются основанием для отказа в принятии к вычету сумм налога.

Поэтому счета-фактуры, выставленные исполнителем после установленного срока, не являются основанием для отказа в принятии к вычету сумм НДС, предъявленных покупателю продавцом.